Учредитель Евразийской ассоциации университетов. 
Является членом Евразийской ассоциации университетов с 1990 года
(II Съезд ЕАУ, 21-23.05.1990 г., Киев)

Южный федеральный университет - один из первых федеральных университетов России. ФГОУ ВПО «Южный федеральный университет» образован в рамках национального проекта «Образование» распоряжением Правительства Российской Федерации от 23 ноября 2006 года № 161-р и приказом Министерства образования и науки Российской Федерации от 4 декабря 2006 года № 1447 «О создании федерального государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Южный федеральный университет» путем присоединения к Ростовскому государственному университету трех вузов: Ростовской государственной академии архитектуры и искусств, Ростовского государственного педагогического университета и Таганрогского государственного радиотехнического университета

Южный федеральный университет видит свою историческую роль в сохранении, накоплении и приумножении нравственных, культурных и научных ценностей общества.

Миссия университета состоит в сохранении и развитии научно-образовательной среды, обеспечивающей формирование граждан, призванных наилучшим образом служить России и всему миру.

Главной стратегической целью Программы развития ЮФУ является создание национального университета мирового уровня, способного оказать существенное влияние на инновационное развитие Южного федерального округа и России, повышение ее национальной безопасности и конкурентоспособности на глобальных рынках технологий и знаний. Университет нового типа призван способствовать модернизации системы высшего профессионального образования, повышению конкурентоспособности ведущих отраслей экономики ЮФО, подготовке   высококвалифицированных специалистов, укреплению научно-образовательных и производственно-технологических связей с зарубежными странами.

Стратегические задачи ЮФУ на период до 2010 года:

• Модернизация образовательного процесса;
• Модернизация научной и инновационной деятельности;
• Развитие персонала;
• Развитие материально-технической базы;
• Совершенствование системы управления.

Для реализации программы развития ЮФУ из федерального бюджета на 2007-2008 гг. выделено 5,350 млрд. рублей.

В настоящее время ЮФУ занимает 4-ю строчку в рейтинге российских университетов, пятое - в рейтинге «Образование академической российской элиты», входит в ТОР-10 в рейтинге "Образование государственной элиты" (апрель, 2008), а в среднесрочной перспективе (2015-2020 гг.) планирует войти в число наиболее престижных вузов мира.