Является членом Евразийской ассоциации университетов с 1989 года
(I Съезд ЕАУ, 20.10.1989 г., Москва)
 

Молдавский Государственный Университет был основан 1 октября 1946 года, первоначальное название - Кишиневский Государственный Университет.

Создание Университета стало важной вехой в развитии и укреплении высшего образования в стране.Это учреждение классического типа, миссия которого — предоставление образования высокого качества.

Первоначально было открыто пять факультетов (Физико-Математических Наук, Геологии и Почвоведения, Биологии, Химии, Истории и Филологии). В первый год (1946-1947) на 12 кафедрах было зарегистрировано 320 человек, образовательный процесс осуществлялся 35 преподавателями.Очень быстро Кишиневский Государственный Университет стал признанным лидером национальной системы высшего образования.

В 1958 году в МолдГУ было открыто заочное отделение, которое функционирует и в настоящее время на некоторых факультетах. Для облегчения подготовки молодых специалистов некоторое время (1958-1981) было открыто и вечернее отделение.

В период 1946-1988 гг. Молд.ГУ был составной частью советской университетской системы, так что управление выполнялось непосредственно из Москвы.

С 1969 Государственный Университет является членом Международной Ассоциации Университетов.

Будучи всегда восприимчивым к общественным нуждам, Университет реорганизовал свою структуру за счет создания новых кафедр и факультетов: Экономический Факультет (1953-1991, 2002), Юридический Факультет (1959), Факультет Техники и Технологии (1959), Факультет Иностранных Языков(1964), Подготовительный Факультет по Обучению Иностранных Граждан (1967), Школа Журналистики (1980), Факультет Философии и Психологии (1994), Факультет Политических Наук (1995)).Некоторые технико-экономические специальности Молдавского Государственного Университета стали основой для создания высших учебных заведений в стране, таких как: Технический Университет Молдовы (1964), Академия Экономических Наук (1991) и Академия Богословия (1993).

С распадом Советского Союза были внесены существенные изменения в сфере высшего образования Республики.1988-1996 годы для Молд.ГУ отмечены совершенствованием традиционных форм обучения и применения новых, современных технологий.

19 января 1990 года КГУ был переименован в Молдавский Государственный Университет.

МолдГУ был первым высшим учебным заведением аккредитованным правительством Республики Молдова, сертификат № 001 был подписан 22 февраля 2001 года, и реаккредитован 28 сентября 2006.

В мае 2005 года Университет присоединенился к Болонскому Процессу и Лиссабонской Конвенции. С 20 июля 2006 года Университет стал профильным членом Академии Наук Республики Молдова.

Молдавский Государственный Университет сегодня насчитывает более 100 000 выпускников различных факультетов и специальностей.За 65 лет МолдГУ подготовил большую часть интеллектуальной элиты Республики Молдова. Выпускники университета являются одними из ведущих деятелей современной науки, основателей научных школ: И. Ц. Гохберг, И. Берсукер, А. Андриеш, С. Рэдэуцан, В. Москаленко, С. Москаленко.

В октябре 2011 года, в связи с 65-летием основания вуза, Молдавский Государственный Университет был удостоен высшей государственной награды – Ордена Республики.